Izgled Niša i ritam života grada značajno su se menjali u ovom razdoblju. Razvoj privrede i porast broja stanovnika Niša i okoline koji su svakodnevno putovali zahtevao je novu organizaciju gradskog i prigradskog prevoza. Tako je, 3. marta 1951. godine, formirano Preduzeće za putnički saobraćaj koje je objedinjavalo tramvajski i moderni autobuski saobraćaj sve do 1958, kada tramvaje u potpunosti zamenjuju autobusi.

Šezdesetih godina Niš postaje i univerzitetski centar, a dobro organizovan prevoz bio je sada potreba i sve većeg broja studenata niških fakulteta. Crveni autobusi u ovom periodu postaju sinonim za svakodnevno fukncionisanje Niša.

Devedesete su predstavljale prekretnicu u poslovanju. U vreme kada ekonomsku stabilnost mnogi nisu uspeli da očuvaju, preduzeće je reorganizovano u skladu sa zahtevima tržišta, vozni park unapređen novim autobusima proizvedenim u pogonima Niš-ekspresa, a saobraćaj se odvijao redovno čak i tokom ratnih godina.

Brojna priznanja u ovom periodu, od kojih je najznačajnija nagrada za najbolju robnu marku Srbije za autobus NIBUS 400, delo Niš-ekspresovog projektantsko-inženjerskog tima, predstavljala su potvrdu da, uprkos izazovima, Niš-ekspres uspešno gradi svoju poziciju lidera. Uvedeni su i prvi internet servisi.

Niš-ekspres je ostao dosledan jasnom planu: stalno podizanje kvaliteta usluga u oblasti prevoza putnika kako na međunarodnim, međumesnim, gradskim linijama, tako i u domenu organizovanog prevoza đaka i zaposlenih.

Stalnim ulaganjem u obnavljanje voznog parka, praćenje i uvođenje novih tehnologija (WiFi u vozilima, internet prodaja karata, aplikacije) u cilju unapređenja korisničkog iskustva, kao i angažovanjem i usavršavanjem voznog i tehničkog osoblja, Niš-ekspres nastavlje da jača poziciju u samom vrhu kompanija koje se bave prevozom putnika.